Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOMER3Q9NSC5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOMER3Q9NSC5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOMER3Q9NSC5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOMER3Q9NSC5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER3Q9NSC5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER3Q9NSC5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOMER3Q9NSC5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HOMER3Q9NSC5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOMER3Q9NSC5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOMER3Q9NSC5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOMER3Q9NSC5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER3Q9NSC5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOMER3Q9NSC5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOMER3Q9NSC5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOMER3Q9NSC5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 314.5 ms