Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TM7SF3Q9NS93 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM7SF3Q9NS93 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TM7SF3Q9NS93 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TM7SF3Q9NS93 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TM7SF3Q9NS93 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms