Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GKN1Q9NS71 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GKN1Q9NS71 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GKN1Q9NS71 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GKN1Q9NS71 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GKN1Q9NS71 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GKN1Q9NS71 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GKN1Q9NS71 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GKN1Q9NS71 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GKN1Q9NS71 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GKN1Q9NS71 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GKN1Q9NS71 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GKN1Q9NS71 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GKN1Q9NS71 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GKN1Q9NS71 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GKN1Q9NS71 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GKN1Q9NS71 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GKN1Q9NS71 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms