Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNIP2Q9NS61 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP2Q9NS61 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNIP2Q9NS61 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP2Q9NS61 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNIP2Q9NS61 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms