Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDF3Q9NR23 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF3Q9NR23 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GDF3Q9NR23 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDF3Q9NR23 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDF3Q9NR23 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDF3Q9NR23 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF3Q9NR23 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF3Q9NR23 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF3Q9NR23 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF3Q9NR23 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF3Q9NR23 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF3Q9NR23 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF3Q9NR23 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GDF3Q9NR23 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF3Q9NR23 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF3Q9NR23 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF3Q9NR23 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms