Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSS2Q9NR19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSS2Q9NR19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACSS2Q9NR19 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACSS2Q9NR19 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ACSS2Q9NR19 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ACSS2Q9NR19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSS2Q9NR19 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSS2Q9NR19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSS2Q9NR19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSS2Q9NR19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACSS2Q9NR19 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACSS2Q9NR19 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACSS2Q9NR19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACSS2Q9NR19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACSS2Q9NR19 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms