Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHST11Q9NPF2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHST11Q9NPF2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHST11Q9NPF2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHST11Q9NPF2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHST11Q9NPF2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms