Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCNMB3Q9NPA1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNMB3Q9NPA1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCNMB3Q9NPA1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCNMB3Q9NPA1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCNMB3Q9NPA1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCNMB3Q9NPA1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KCNMB3Q9NPA1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNMB3Q9NPA1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNMB3Q9NPA1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNMB3Q9NPA1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNMB3Q9NPA1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNMB3Q9NPA1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNMB3Q9NPA1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNMB3Q9NPA1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KCNMB3Q9NPA1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNMB3Q9NPA1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNMB3Q9NPA1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms