Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF12AQ9NP84 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF12AQ9NP84 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF12AQ9NP84 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF12AQ9NP84 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF12AQ9NP84 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF12AQ9NP84 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF12AQ9NP84 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFRSF12AQ9NP84 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF12AQ9NP84 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF12AQ9NP84 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF12AQ9NP84 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFRSF12AQ9NP84 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms