Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabgef1Q9JM13 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rabgef1Q9JM13 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rabgef1Q9JM13 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rabgef1Q9JM13 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rabgef1Q9JM13 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rabgef1Q9JM13 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms