Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI3

Mmel1, Membrane metallo-endopeptidase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmel1Q9JLI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mmel1Q9JLI3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mmel1Q9JLI3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mmel1Q9JLI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mmel1Q9JLI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mmel1Q9JLI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mmel1Q9JLI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mmel1Q9JLI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mmel1Q9JLI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mmel1Q9JLI3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mmel1Q9JLI3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mmel1Q9JLI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mmel1Q9JLI3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mmel1Q9JLI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mmel1Q9JLI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mmel1Q9JLI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mmel1Q9JLI3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms