Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AtrQ9JKK8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AtrQ9JKK8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AtrQ9JKK8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
AtrQ9JKK8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AtrQ9JKK8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AtrQ9JKK8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AtrQ9JKK8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AtrQ9JKK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AtrQ9JKK8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
AtrQ9JKK8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AtrQ9JKK8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
AtrQ9JKK8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms