Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mrpl39Q9JKF7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mrpl39Q9JKF7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mrpl39Q9JKF7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mrpl39Q9JKF7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms