Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN6

GP6, Platelet glycoprotein VI, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP6Q9HCN6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GP6Q9HCN6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GP6Q9HCN6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GP6Q9HCN6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GP6Q9HCN6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GP6Q9HCN6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GP6Q9HCN6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GP6Q9HCN6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP6Q9HCN6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP6Q9HCN6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GP6Q9HCN6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP6Q9HCN6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GP6Q9HCN6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GP6Q9HCN6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GP6Q9HCN6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GP6Q9HCN6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms