Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPB41L5Q9HCM4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPB41L5Q9HCM4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPB41L5Q9HCM4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
EPB41L5Q9HCM4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPB41L5Q9HCM4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPB41L5Q9HCM4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPB41L5Q9HCM4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPB41L5Q9HCM4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPB41L5Q9HCM4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L5Q9HCM4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPB41L5Q9HCM4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPB41L5Q9HCM4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPB41L5Q9HCM4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPB41L5Q9HCM4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EPB41L5Q9HCM4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPB41L5Q9HCM4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1377.1 ms