Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCI7

MSL2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL2Q9HCI7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSL2Q9HCI7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSL2Q9HCI7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL2Q9HCI7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSL2Q9HCI7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSL2Q9HCI7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms