Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBT6

CDH20, Cadherin-20, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH20Q9HBT6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH20Q9HBT6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH20Q9HBT6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH20Q9HBT6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH20Q9HBT6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH20Q9HBT6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH20Q9HBT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms