Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPCSQ9HAB8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPCSQ9HAB8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPCSQ9HAB8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPCSQ9HAB8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPCSQ9HAB8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPCSQ9HAB8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPCSQ9HAB8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPCSQ9HAB8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPCSQ9HAB8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPCSQ9HAB8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPCSQ9HAB8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPCSQ9HAB8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPCSQ9HAB8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPCSQ9HAB8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPCSQ9HAB8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms