Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTD2Q9H8S5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTD2Q9H8S5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTD2Q9H8S5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTD2Q9H8S5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms