Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C10orf88Q9H8K7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
C10orf88Q9H8K7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C10orf88Q9H8K7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C10orf88Q9H8K7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
C10orf88Q9H8K7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
C10orf88Q9H8K7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C10orf88Q9H8K7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C10orf88Q9H8K7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C10orf88Q9H8K7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms