Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP13A3Q9H7F0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP13A3Q9H7F0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP13A3Q9H7F0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP13A3Q9H7F0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP13A3Q9H7F0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP13A3Q9H7F0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms