Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLMPQ9H6B4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLMPQ9H6B4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLMPQ9H6B4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMPQ9H6B4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLMPQ9H6B4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLMPQ9H6B4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms