Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC68Q9H2F9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC68Q9H2F9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC68Q9H2F9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC68Q9H2F9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC68Q9H2F9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC68Q9H2F9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC68Q9H2F9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms