Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2A9

CHST8, Carbohydrate sulfotransferase 8, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST8Q9H2A9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST8Q9H2A9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHST8Q9H2A9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHST8Q9H2A9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHST8Q9H2A9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST8Q9H2A9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST8Q9H2A9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST8Q9H2A9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST8Q9H2A9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHST8Q9H2A9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST8Q9H2A9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST8Q9H2A9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST8Q9H2A9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHST8Q9H2A9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST8Q9H2A9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHST8Q9H2A9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms