Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chrnb2Q9ERK7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chrnb2Q9ERK7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrnb2Q9ERK7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrnb2Q9ERK7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrnb2Q9ERK7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrnb2Q9ERK7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrnb2Q9ERK7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms