Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlnrd1Q9ERE8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlnrd1Q9ERE8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlnrd1Q9ERE8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlnrd1Q9ERE8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlnrd1Q9ERE8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlnrd1Q9ERE8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlnrd1Q9ERE8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlnrd1Q9ERE8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlnrd1Q9ERE8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlnrd1Q9ERE8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlnrd1Q9ERE8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlnrd1Q9ERE8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlnrd1Q9ERE8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlnrd1Q9ERE8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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