Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sall1Q9ER74 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sall1Q9ER74 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall1Q9ER74 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall1Q9ER74 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms