Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx12Q9ER00 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx12Q9ER00 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx12Q9ER00 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx12Q9ER00 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx12Q9ER00 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx12Q9ER00 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stx12Q9ER00 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx12Q9ER00 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx12Q9ER00 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx12Q9ER00 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms