Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rp2Q9EPK2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rp2Q9EPK2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp2Q9EPK2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp2Q9EPK2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp2Q9EPK2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms