Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CrotQ9DC50 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CrotQ9DC50 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrotQ9DC50 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrotQ9DC50 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CrotQ9DC50 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrotQ9DC50 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CrotQ9DC50 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CrotQ9DC50 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CrotQ9DC50 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CrotQ9DC50 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CrotQ9DC50 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CrotQ9DC50 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CrotQ9DC50 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CrotQ9DC50 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrotQ9DC50 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrotQ9DC50 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrotQ9DC50 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CrotQ9DC50 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CrotQ9DC50 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrotQ9DC50 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CrotQ9DC50 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrotQ9DC50 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CrotQ9DC50 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CrotQ9DC50 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms