Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc97Q9DBT3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc97Q9DBT3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc97Q9DBT3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc97Q9DBT3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc97Q9DBT3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc97Q9DBT3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc97Q9DBT3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc97Q9DBT3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc97Q9DBT3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc97Q9DBT3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc97Q9DBT3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc97Q9DBT3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc97Q9DBT3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc97Q9DBT3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc97Q9DBT3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc97Q9DBT3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc97Q9DBT3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms