Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Smco2Q9DA21 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smco2Q9DA21 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smco2Q9DA21 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smco2Q9DA21 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smco2Q9DA21 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smco2Q9DA21 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smco2Q9DA21 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smco2Q9DA21 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smco2Q9DA21 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smco2Q9DA21 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Smco2Q9DA21 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smco2Q9DA21 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smco2Q9DA21 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smco2Q9DA21 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smco2Q9DA21 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smco2Q9DA21 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smco2Q9DA21 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smco2Q9DA21 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smco2Q9DA21 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smco2Q9DA21 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smco2Q9DA21 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smco2Q9DA21 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms