Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calr3Q9D9Q6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr3Q9D9Q6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calr3Q9D9Q6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Calr3Q9D9Q6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr3Q9D9Q6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr3Q9D9Q6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr3Q9D9Q6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calr3Q9D9Q6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calr3Q9D9Q6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calr3Q9D9Q6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calr3Q9D9Q6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calr3Q9D9Q6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr3Q9D9Q6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr3Q9D9Q6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr3Q9D9Q6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Calr3Q9D9Q6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr3Q9D9Q6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms