Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D8Q6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D8Q6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q9D8Q6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D8Q6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D8Q6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms