Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf225Q9D7D1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rnf225Q9D7D1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf225Q9D7D1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rnf225Q9D7D1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf225Q9D7D1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf225Q9D7D1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf225Q9D7D1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf225Q9D7D1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf225Q9D7D1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf225Q9D7D1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf225Q9D7D1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf225Q9D7D1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf225Q9D7D1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf225Q9D7D1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf225Q9D7D1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf225Q9D7D1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf225Q9D7D1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf225Q9D7D1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf225Q9D7D1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf225Q9D7D1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf225Q9D7D1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf225Q9D7D1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rnf225Q9D7D1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf225Q9D7D1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf225Q9D7D1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms