Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930513O06RikQ9D549 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930513O06RikQ9D549 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930513O06RikQ9D549 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930513O06RikQ9D549 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930513O06RikQ9D549 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930513O06RikQ9D549 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930513O06RikQ9D549 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4930513O06RikQ9D549 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930513O06RikQ9D549 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930513O06RikQ9D549 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930513O06RikQ9D549 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930513O06RikQ9D549 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930513O06RikQ9D549 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930513O06RikQ9D549 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930513O06RikQ9D549 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930513O06RikQ9D549 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930513O06RikQ9D549 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930513O06RikQ9D549 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930513O06RikQ9D549 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930513O06RikQ9D549 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930513O06RikQ9D549 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930513O06RikQ9D549 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930513O06RikQ9D549 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930513O06RikQ9D549 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms