Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Odf2lQ9D478 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Odf2lQ9D478 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Odf2lQ9D478 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Odf2lQ9D478 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Odf2lQ9D478 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Odf2lQ9D478 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Odf2lQ9D478 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Odf2lQ9D478 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Odf2lQ9D478 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Odf2lQ9D478 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Odf2lQ9D478 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Odf2lQ9D478 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Odf2lQ9D478 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Odf2lQ9D478 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Odf2lQ9D478 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Odf2lQ9D478 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Odf2lQ9D478 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Odf2lQ9D478 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Odf2lQ9D478 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Odf2lQ9D478 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Odf2lQ9D478 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Odf2lQ9D478 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Odf2lQ9D478 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Odf2lQ9D478 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Odf2lQ9D478 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Odf2lQ9D478 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Odf2lQ9D478 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Odf2lQ9D478 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Odf2lQ9D478 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Odf2lQ9D478 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Odf2lQ9D478 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms