Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Katnal2Q9D3R6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Katnal2Q9D3R6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Katnal2Q9D3R6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Katnal2Q9D3R6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Katnal2Q9D3R6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Katnal2Q9D3R6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Katnal2Q9D3R6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Katnal2Q9D3R6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Katnal2Q9D3R6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Katnal2Q9D3R6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Katnal2Q9D3R6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Katnal2Q9D3R6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Katnal2Q9D3R6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Katnal2Q9D3R6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Katnal2Q9D3R6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Katnal2Q9D3R6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Katnal2Q9D3R6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Katnal2Q9D3R6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katnal2Q9D3R6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms