Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H6

Ndufaf4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf4Q9D1H6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufaf4Q9D1H6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufaf4Q9D1H6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufaf4Q9D1H6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufaf4Q9D1H6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf4Q9D1H6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf4Q9D1H6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf4Q9D1H6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufaf4Q9D1H6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufaf4Q9D1H6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf4Q9D1H6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf4Q9D1H6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf4Q9D1H6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf4Q9D1H6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf4Q9D1H6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufaf4Q9D1H6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndufaf4Q9D1H6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf4Q9D1H6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf4Q9D1H6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf4Q9D1H6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf4Q9D1H6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf4Q9D1H6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf4Q9D1H6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf4Q9D1H6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms