Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ss18l2Q9D174 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ss18l2Q9D174 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ss18l2Q9D174 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ss18l2Q9D174 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ss18l2Q9D174 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms