Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc167Q9D162 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc167Q9D162 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc167Q9D162 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc167Q9D162 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc167Q9D162 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc167Q9D162 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc167Q9D162 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc167Q9D162 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc167Q9D162 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc167Q9D162 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc167Q9D162 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc167Q9D162 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc167Q9D162 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc167Q9D162 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc167Q9D162 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc167Q9D162 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms