Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610524H06RikQ9CZU9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610524H06RikQ9CZU9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610524H06RikQ9CZU9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610524H06RikQ9CZU9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610524H06RikQ9CZU9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
2610524H06RikQ9CZU9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
2610524H06RikQ9CZU9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
2610524H06RikQ9CZU9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
2610524H06RikQ9CZU9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
2610524H06RikQ9CZU9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
2610524H06RikQ9CZU9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms