Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nde1Q9CZA6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nde1Q9CZA6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nde1Q9CZA6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nde1Q9CZA6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nde1Q9CZA6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms