Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
4930535I16RikQ9CUI2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930535I16RikQ9CUI2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930535I16RikQ9CUI2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930535I16RikQ9CUI2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930535I16RikQ9CUI2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930535I16RikQ9CUI2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930535I16RikQ9CUI2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930535I16RikQ9CUI2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930535I16RikQ9CUI2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930535I16RikQ9CUI2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930535I16RikQ9CUI2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930535I16RikQ9CUI2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930535I16RikQ9CUI2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms