Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lhfpl3Q9CTN8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lhfpl3Q9CTN8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lhfpl3Q9CTN8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lhfpl3Q9CTN8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lhfpl3Q9CTN8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lhfpl3Q9CTN8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms