Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA9

Fgfr1op2, FGFR1 oncogene partner 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1op2Q9CRA9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr1op2Q9CRA9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fgfr1op2Q9CRA9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgfr1op2Q9CRA9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgfr1op2Q9CRA9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgfr1op2Q9CRA9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgfr1op2Q9CRA9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgfr1op2Q9CRA9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgfr1op2Q9CRA9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgfr1op2Q9CRA9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgfr1op2Q9CRA9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgfr1op2Q9CRA9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgfr1op2Q9CRA9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgfr1op2Q9CRA9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgfr1op2Q9CRA9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgfr1op2Q9CRA9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgfr1op2Q9CRA9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgfr1op2Q9CRA9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgfr1op2Q9CRA9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgfr1op2Q9CRA9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgfr1op2Q9CRA9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgfr1op2Q9CRA9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms