Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ankrd1Q9CR42 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd1Q9CR42 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ankrd1Q9CR42 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd1Q9CR42 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ankrd1Q9CR42 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd1Q9CR42 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd1Q9CR42 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ankrd1Q9CR42 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ankrd1Q9CR42 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd1Q9CR42 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd1Q9CR42 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd1Q9CR42 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ankrd1Q9CR42 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd1Q9CR42 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd1Q9CR42 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd1Q9CR42 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd1Q9CR42 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd1Q9CR42 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd1Q9CR42 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd1Q9CR42 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd1Q9CR42 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd1Q9CR42 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd1Q9CR42 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ankrd1Q9CR42 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd1Q9CR42 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ankrd1Q9CR42 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd1Q9CR42 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ankrd1Q9CR42 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ankrd1Q9CR42 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ankrd1Q9CR42 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ankrd1Q9CR42 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ankrd1Q9CR42 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms