Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ykt6Q9CQW1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ykt6Q9CQW1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ykt6Q9CQW1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ykt6Q9CQW1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ykt6Q9CQW1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ykt6Q9CQW1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ykt6Q9CQW1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ykt6Q9CQW1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ykt6Q9CQW1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ykt6Q9CQW1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ykt6Q9CQW1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ykt6Q9CQW1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ykt6Q9CQW1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ykt6Q9CQW1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ykt6Q9CQW1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms