Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Map1lc3bQ9CQV6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Map1lc3bQ9CQV6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Map1lc3bQ9CQV6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Map1lc3bQ9CQV6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Map1lc3bQ9CQV6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Map1lc3bQ9CQV6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Map1lc3bQ9CQV6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Map1lc3bQ9CQV6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Map1lc3bQ9CQV6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Map1lc3bQ9CQV6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Map1lc3bQ9CQV6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms