Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCLK3Q9C098 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCLK3Q9C098 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCLK3Q9C098 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DCLK3Q9C098 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
DCLK3Q9C098 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCLK3Q9C098 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DCLK3Q9C098 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCLK3Q9C098 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DCLK3Q9C098 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DCLK3Q9C098 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DCLK3Q9C098 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DCLK3Q9C098 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DCLK3Q9C098 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DCLK3Q9C098 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DCLK3Q9C098 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DCLK3Q9C098 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms